Huang Qi foi detido no dia 10 de Junho de 2008 e até Setembro do mesmo ano foi mantido em regime de incomunicabilidade, porque o caso envolvia segredos de Estado. Ao contrário do que está previsto no Processo Penal da China a data do julgamento não foi tornada pública e foi negada ao advogado de defesa a possibilidade de fotocopiar o processo. Em Agosto de 2009 teve início o julgamento à porta fechada, contudo este não correspondeu aos padrões internacionais, uma vez que entre outras coisas o depoimento de várias testemunhas a favor de Huang Qi foi proibido. 

O estado de saúde do defensor dos Direitos Humanos tem vindo a deteriorar-se rapidamente, de acordo com o seu advogado o médico do estabelecimento prisional diagnosticou-lhe dois tumores, a família de Huang Qi não o pode visitar e teme que não este esteja a receber o tratamento médico adequado. A Amnistia Internacional acredita que Huang Qi foi tratada de forma cruel durante a sua custódia.